Kaset Ekspresi Gen Penyandi Kitinase dari Sorgum (Sorghum bicolor (L.) Moench) Indonesia Aksesi Kempul

Deskripsi

Invensi ini bertujuan menyediakan kaset ekspresi gen penyandi kitinase dari sorgum(Sorghum bicolor (L.) Moench) Indonesia, dengan kode aksesi Kempul, 05005-00928, yangdimodifikasi dengan penambahan penanda fluoresensi digabung dengan penanda afinitas.Kaset ekspresi tersebut dicirikan dengan urutan basa nukleotida pada SEQ ID No. 3 danmenyandikan suatu sekuen asam amino putatif kitinase dengan sekuen asam amino padaSEQ ID No. 4. Invensi ini juga berkaitan dengan pasangan primer yang digunakan untukmengamplifikasi fragmen dalam kaset ekspresi gen penyandi kitinase dari sorgum(Sorghum bicolor (L.) Moench) Indonesia aksesi kempul, yaitu pasangan primer untukmengamplifikasi fragmen gen penyandi kitinase sorgum, berupa primer3_CDS_Sobic.CHIT1-2_F: 5’- GCGGCCGCACTAGTGATATCATGACGATGAGAGCACTGCTG-3’dan primer 4_CDS_Sobic.CHIT1-2_R: 5’-CACCATCGAACCACCACCACCGGAGCTGTTGAAGGGCATC-3’. Pasangan primer untukmengamplifikasi penanda fluoresensi mKate berupa primer 5_mKate_F: 5’-GGTGGTGGTGGTTCGATGGTGAGCGAGCTGATTAAGG-3’ dan primer 6_mKate_HisTag_R: 5’ -TTAGTGATGGTGATGGTGATGTTCGCCAATTCTGTGCCCCAG- 3, yang dirancang dengantambahan sekuen penyandi 6xHis. Serta, pasangan primer untuk inverse PCR, yangdigunakan untuk mengamplifikasi kerangka vektor pK7WG2 (VIB 1_10) yang membawapromoter dan terminator 35S berupa primer 1_HisTag_pK7WG2_F: 5’-CATCACCATCACCATCACTAAGATATCCCGCGGCCATGC-3’ dan primer 2_pK7WG2_R: 5’-GATATCACTAGTGCGGCCGC-3’. Invensi ini juga berkaitan dengan pustaka plasmidrekombinan yang mengandung bagian dari kaset ekspresi gen penyandi kitinase darisorgum (Sorghum bicolor (L.) Moench) Indonesia aksesi kempul. Kaset ekspresi menurutinvensi ini dapat digunakan dalam pustaka plasmid rekombinan untuk karakterisasifungsional dan struktural kitinase.

Kata Kunci