BRIN Logo
Sign In
Main Product Image

Solusi Deteksi Dini Bakteri Patogen Bawang dengan Akurasi Molekuler 197-pb

Agenda Riset: Kedaulatan Pangan
Sektor: Pangan

Deskripsi

Invensi ini berkaitan dengan primer spesifik untuk deteksi bakteri Pantoea sp. sebagai penyebab penyakit hawar daun bakteri pada tanaman bawang merah ( Allium ascalonicumL.), khususnya untuk digunakan dalam metode deteksi menggunakan polymerase chain reaction (PCR) untuk amplifikasi gen Alt dari bakteri Pantoea sp. sedemikian hingga diperoleh amplikon yang mengkonfirmasi identitas bakteri Pantoea sp. Primer spesifik menurut invensi terkini yaitu Pa_AltF: 5’-TCT GGT CCG ATC TGG TCT GT-3’ dan Pa_AltR: 5’-CAT CAT CAG CTC AGC GTT GC-3’. Primer tersebut digunakan dalam metode deteksi bakteri patogen Pantoea sp. pada tanaman bawang merah menggunakan PCR dengan kondisi proses pre-denaturasi pada suhu 95oC selama 5 – 10 menit; denaturasi pada suhu 95oC selama 30 – 60 detik; penempelan primer pada suhu 60 - 65oC selama 30 – 60 detik; pemanjangan dan pembentukan DNA pada suhu 72oC selama 60-90 detik; dan pemanjangan akhir pada suhu 72oC selama 5-10 menit; di mana denaturasi - pemanjangan dilakukan sebanyak 40 - 45 siklus. Penentuan hasil dilakukan dengan menggunakan elektroforesis gel agarosa dengan konsentrasi 1 - 2%, di mana hasil pemeriksaan dikatakan positif jika muncul pita DNA target berukuran 197 pasang basa (pb).

Kata Kunci

Bawang-Guard Bio-Precise Deteksi-Cepat Gen-Scan Phyto-Lock

Dokumen Download

  • Deteksi bakteri Pantoea sp. dengan akurasi tinggi melalui amplifikasi gen spesifik (Alt) untuk hasil diagnosis yang tidak terbantahkan.
  • Proses identifikasi yang cepat dan responsif, memungkinkan tindakan pencegahan hawar daun dilakukan lebih dini sebelum wabah meluas.
  • Memberikan hasil konfirmasi positif yang jelas (pita DNA 197 pb) sehingga meminimalisir kesalahan diagnosis penyakit tanaman.
  • Solusi vital bagi laboratorium karantina dan pemulia tanaman untuk menjamin benih bawang merah bebas patogen (Pathogen-Free).
  • Mendukung keberlanjutan panen dengan sistem deteksi molekuler yang stabil dan kompatibel dengan standar mesin PCR laboratorium.